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- 1-7章提过了
- 8章：经验共价键键模拟 计算反应
基函数的概述 单个基函数由一个或多个原始高斯函数构成。例如，s-型基函数 φµ(r)是一个高斯分布型函数称为s-型基函数，一个壳层是一套有共同指数的基函数φµ。Gaussian支持任意角动量的壳层：s，p，d，f，g，h五层。一个s-壳层包含一个单独的s-型基函数。一个p-壳层包含三个基函数pX，pY和pZ。sp-壳层包含四个具有共同高斯指数的基函数：一个s-型函数和三个p-函数pX，pY和pZ。 - AMBER18里搜hessian发现有一个关于second derivative的，但似乎用到mme2，不懂，也没搜到
有一个CartHess2FC.py的模块用了output Hessian 以为是它，实际上利用的是Gaussian输出的fchk文件
小木虫上看到很成熟的利用Gaussian解决hessian乃至找本征频率的做法，http://muchong.com/html/201504/8775391_2.html，15年就有了 改变搜索思路，找fchk，找到了量子动力学模块
PIMD可以做模拟，一种是PRIMPIMD和NMPIMD（normal mode path-integral），后者是一种更好的方式，解耦谐波项（在谐波项看到了正则化中的频率ω）流泪了好兄弟
实践证明，以hessian为关键词搜一遍，发现，但凡涉及到的都是偷Gaussian的现成文件来用，也太垃圾了amber，呜呜呜，浪费我一个月啊!!!!!!!!!
hessian的本质是3n-6个振动自由度的频率值，3n个自由度，但去掉3个振动自由度，3个转动自由度，他们的改变不影响体系相对位置，也就不改变体系能量。